- a -

• activatelogger() : loggingmodule
• addsparsevectors() : sparsevectormodule
• appendtotripletlist() : tripletlistmodule

- c -

• cgsolver() : linearsolversmodule
• chebyshevcompute() : chebyshevsolversmodule
• checkallocerror() : errormodule
• checkdistributedmemorypoolvalidity() : distributedmatrixmemorypoolmodule
• checkmemorypoolvalidity() : matrixmemorypoolmodule
• checkmpierror() : errormodule
• cleanup() : errormodule
• comparetriplets() : tripletmodule
• composesparsematrix() : sparsematrixmodule
• composesparsematrixcolumns() : sparsematrixmodule
• computeexponential() : exponentialsolversmodule
• computeexponentialpade() : exponentialsolversmodule
• computeexponentialtaylor() : exponentialsolversmodule
• computeinverseroot() : rootsolversmodule
• computelogarithm() : exponentialsolversmodule
• computelogarithmtaylor() : exponentialsolversmodule
• computeroot() : rootsolversmodule
• computesigma() : distributedsparsematrixalgebramodule
• conjugategradient() : minimizersolversmodule
• constructchebyshevpolynomial() : chebyshevsolversmodule
• constructdefaultpermutation() : permutationmodule
• constructdensefromsparse() : densematrixmodule
• constructdistributedmatrixmemorypool() : distributedmatrixmemorypoolmodule
• constructemptydistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule
• constructemptysparsematrix() : sparsematrixmodule
• constructfrombinary() : distributedsparsematrixmodule
• constructfrommatrixmarket() : distributedsparsematrixmodule
• constructfromtripletlist() : sparsematrixmodule
• constructhermitepolynomial() : hermitesolversmodule
• constructmatrixmemorypool() : matrixmemorypoolmodule
• constructpolynomial() : polynomialsolversmodule
• ConstructProcessGrid() : NTPoly
• constructprocessgrid() : processgridmodule
• constructrandompermutation() : permutationmodule
• constructreversepermutation() : permutationmodule
• constructsparsefromdense() : densematrixmodule
• constructsparsematrixfromfile() : sparsematrixmodule
• constructtripletlist() : tripletlistmodule
• constructzerosparsematrix() : sparsematrixmodule
• convertfixedtoiterative() : parameterconvertermodule
• convertiterativetofixed() : parameterconvertermodule
• copydistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule
• copysparsematrix() : sparsematrixmodule
• cosine() : trigonometrysolversmodule

- d -

• deactivatelogger() : loggingmodule
• destructchebyshevpolynomial() : chebyshevsolversmodule
• destructdistributedmatrixmemorypool() : distributedmatrixmemorypoolmodule
• destructdistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule
• destructhermitepolynomial() : hermitesolversmodule
• destructmatrixmemorypool() : matrixmemorypoolmodule
• destructpermutation() : permutationmodule
• destructpolynomial() : polynomialsolversmodule
• DestructProcessGrid() : NTPoly
• destructprocessgrid() : processgridmodule
• destructsparsematrix() : sparsematrixmodule
• destructtripletlist() : tripletlistmodule
• distributedgemm() : distributedsparsematrixalgebramodule
• distributedgrandsum() : distributedsparsematrixalgebramodule
• distributedpairwisemultiply() : distributedsparsematrixalgebramodule
• distributedsparsenorm() : distributedsparsematrixalgebramodule
• dotdistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixalgebramodule
• dotsparsematrix() : sparsematrixalgebramodule
• dotsparsevectors() : sparsevectormodule

- e -

• entersublog() : loggingmodule
• erroroccurred() : errormodule
• exitsublog() : loggingmodule
• extractcolumn() : sparsematrixmodule
• extractrow() : sparsematrixmodule

- f -

• factorizedchebyshevcompute() : chebyshevsolversmodule
• filldistributedidentity() : distributedsparsematrixmodule
• filldistributedpermutation() : distributedsparsematrixmodule
• fillfromtripletlist() : distributedsparsematrixmodule
• filterdistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule

- g -

• gatherandcomposecleanup() : matrixgathermodule
• gatherandcomposedata() : matrixgathermodule
• gatherandsumcleanup() : matrixgathermodule
• gatherandsumdata() : matrixgathermodule
• gathersizes() : matrixgathermodule
• gemm() : sparsematrixalgebramodule
• gershgorinbounds() : eigenboundsmodule
• getactualdimension() : distributedsparsematrixmodule
• getcolumns() : sparsematrixmodule
• getloadbalance() : distributedsparsematrixmodule
• getlogicaldimension() : distributedsparsematrixmodule
• getmatrixblock() : distributedsparsematrixmodule
• getmpitriplettype() : tripletmodule
• GetMyColumn() : NTPoly
• getmycolumn() : processgridmodule
• GetMyRow() : NTPoly
• getmyrow() : processgridmodule
• GetMySlice() : NTPoly
• getmyslice() : processgridmodule
• getrows() : sparsematrixmodule
• getsize() : distributedsparsematrixmodule
• gettripletat() : tripletlistmodule
• gettripletlist() : distributedsparsematrixmodule
• gettripletlistsize() : tripletlistmodule
• gettripletvalues() : tripletmodule

- h -

• hermitecompute() : hermitesolversmodule
• hornercompute() : polynomialsolversmodule
• hpcp() : densitymatrixsolversmodule

- i -

• incrementdistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixalgebramodule
• incrementsparsematrix() : sparsematrixalgebramodule
• inversesquareroot() : squarerootsolversmodule
• invert() : inversesolversmodule
• isroot() : processgridmodule

- l -

• lowdinextrapolate() : geometryoptimizationmodule

- m -

• matrixtotripletlist() : sparsematrixmodule
• mergelocalblocks() : distributedsparsematrixmodule
• mpitypeinfoinit() : datatypesmodule
• multiplydense() : densematrixmodule

- n -

• next() : sparsematrixiteratormodule

- p -

• pairwisemultiplysparsematrix() : sparsematrixalgebramodule
• pairwisemultiplyvectors() : sparsevectormodule
• parsemmheader() : matrixmarketmodule
• patersonstockmeyercompute() : polynomialsolversmodule
• permutematrix() : loadbalancermodule
• pm() : densitymatrixsolversmodule
• polardecomposition() : signsolversmodule
• powerbounds() : eigenboundsmodule
• printalltimers() : timermodule
• printalltimersdistributed() : timermodule
• printdistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule
• printerror() : errormodule
• printfixedsolverparameters() : fixedsolversmodule
• printiterativesolverparameters() : iterativesolversmodule
• printmatrixinformation() : distributedsparsematrixmodule
• printsparsematrix() : sparsematrixmodule
• printtimer() : timermodule
• pseudoinverse() : inversesolversmodule
• purificationextrapolate() : geometryoptimizationmodule

- r -

• redistributetripletlists() : tripletlistmodule
• registertimer() : timermodule
• resizetripletlist() : tripletlistmodule

- s -

• scaledistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixalgebramodule
• scalesparsematrix() : sparsematrixalgebramodule
• scalesquaretrigonometrytaylor() : trigonometrysolversmodule
• setchebyshevcoefficient() : chebyshevsolversmodule
• setcoefficient() : polynomialsolversmodule
• setfixedbeverbose() : fixedsolversmodule
• setfixedloadbalance() : fixedsolversmodule
• setfixedthreshold() : fixedsolversmodule
• setgenericerror() : errormodule
• sethermitecoefficient() : hermitesolversmodule
• setiterativebeverbose() : iterativesolversmodule
• setiterativeconvergediff() : iterativesolversmodule
• setiterativeloadbalance() : iterativesolversmodule
• setiterativemaxiterations() : iterativesolversmodule
• setiterativethreshold() : iterativesolversmodule
• setpoolsparsity() : matrixmemorypoolmodule
• settriplet() : tripletmodule
• settripletat() : tripletlistmodule
• shifttripletlist() : tripletlistmodule
• signfunction() : signsolversmodule
• sine() : trigonometrysolversmodule
• sorttripletlist() : tripletlistmodule
• sparsematrixgrandsum() : sparsematrixalgebramodule
• sparsematrixnorm() : sparsematrixalgebramodule
• splitsparsematrix() : sparsematrixmodule
• splitsparsematrixcolumns() : sparsematrixmodule
• squareroot() : squarerootsolversmodule
• start() : sparsematrixiteratormodule
• starttimer() : timermodule
• stoptimer() : timermodule
• symmetrizetripletlist() : tripletlistmodule

- t -

• testdatarequest() : matrixgathermodule
• testinnerrequest() : matrixgathermodule
• testouterrequest() : matrixgathermodule
• testsizerequest() : matrixgathermodule
• trace() : distributedsparsematrixalgebramodule
• transposedistributedsparsematrix() : distributedsparsematrixmodule
• transposesparsematrix() : sparsematrixmodule
• trs2() : densitymatrixsolversmodule
• trs4() : densitymatrixsolversmodule

- u -

• undopermutematrix() : loadbalancermodule

- w -

• writecitation() : loggingmodule
• writeelement() : loggingmodule
• writeheader() : loggingmodule
• writelistelement() : loggingmodule
• writetobinary() : distributedsparsematrixmodule
• writetomatrixmarket() : distributedsparsematrixmodule